本文作者
Authors
李小杉钟平李伟杜国平方坤
宋玥朱可心郭艳高蓉颜文娟
宣杨卫平民
东南大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系；上海市疾病预防控制中心艾滋病性病麻风病防治科；南京市疾病预防控制中心；南通大学公共卫生学院；东南大学医学院病原微生物学与免疫学系
摘要
构建我国HIV-1CRF01_AE毒株分子传播网络，并分析网络特征。
从洛斯阿拉莫斯国家实验室HIV基因数据库（LosAlamosdatabase）下载中国地区的CRF01_AEpol区基因序列并进行人口学信息核对。通过构建系统进化树、提取传播簇、最小基因距离选择及传播网络可视化4个步骤构建传播网络。运用卡方检验分析不同人群参与网络形成的比例和网络中度的分布。描述性分析不同人群和不同地区之间的传播关联。
条序列共形成个大小介于2～25的传播网络，包括个节点和条边。度≥2的个体虽然只占网络中个体总数的26.4%（/），但与66.5%（/）的个体存在关联。男男同性性行为者（MSM）、男性异性性行为者、静脉药瘾者（IDUs）及女性异性性行为者参与网络形成的比例分别为37.6%（/）、28.4%（/）、16.1%（10/62）和30.4%（66/），差异有统计学意义（χ2=23.，P0.)。MSM人群中度≥2的比例（10.8%，/）显著高于男性异性性行为者（5.6%，20/）和女性异性性行为者（4.6%，10/）（P值分别为0.和0.）。网络中绝大多数（95.5%，/）MSM与其他MSM之间存在传播关联，仅有2.4%（16/）的个体与女性异性性行为者之间存在传播关联，但有15.1%（10/66）的女性异性性行为者与MSM之间存在传播关联。男性异性性行为者与女性异性性行为者之间存在传播关联的比例为35.3%（36/），与MSM之间具有传播关联的比例为9.8%（10/）。网络中20.9%（/）的个体与其他省份之间存在传播关联。
较少比例的超级传播者在CRF01_AE毒株的分子传播网络形成中起到了核心作用，不同人群和不同地区之间的毒株进行着活跃的传播。
CRF01_AE毒株；分子流行病学；传播网络；传播簇；系统进化分析
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