灭活疫苗抗原是完整的病毒颗粒，具有充分的B细胞位点和T细胞位点。流行口蹄疫病毒毒株微小的变异对疫苗效果不会产生颠覆性的影响。由于灭活疫苗采用双相佐剂，产生免疫应答也较快。其缺点在于过敏反应难以完全克服。 合成肽疫苗只有单一抗原位点的多肽（仅有41个氨基酸），对特定毒株具有较强的免疫力，但流行毒株微小的变异对其影响较大。由于采用单相油佐剂，免疫应答较慢。由于合成肽不存在异体蛋白，几乎不产生过敏反应。 综合两者的特点，采用两者交互免疫可以取长补断。由于两者之间抗原共性比例较大，交互免疫可以起到相互加强的作用。由于两者间仍存在差异，利于抗原的相互补充，同时减少了各自的抗体对另一方疫苗抗原的封闭而造成的干扰现象。
项 目
合成肽疫苗
灭活疫苗（进口佐剂）
免疫类型
体液免疫、细胞免疫
体液免疫、细胞免疫
剂 型
油包水型（W/O）
水包油包水型（W/O/W）
免疫机制
同灭活疫苗
灭活疫苗
免疫持续期
抗体水平维持至少6个月
抗体水平维持2～6个月
不良反应
无不良反应
发热、过敏反应、流产甚至死亡
生物安全隐患
无
存在灭活不完全隐患
免疫剂量
1ml
2~3ml
灭活剂
不使用
二乙烯亚胺（BEI）
稳定性
保存期内免疫效力不降低
保存期内免疫效力可能降低
佐 剂
法国SEPPICMontanideISA50V
法国SEPPICMontanideISA
抗原成份
纯净的特异性多肽
灭活的病毒S粒子
抗原含量
25μg/头份
1.5μg/头份左右
疫苗纯净度
纯净
含细胞碎片、变性蛋白、非结构蛋白等杂质
温度敏感性
2～8℃保存，疫苗免疫效力受温度变化影响相对较小
2～8℃保存，疫苗免疫效力受温度变化影响相对较大
生产方法
固相合成法
细胞培养
鉴别诊断
可鉴别野毒与疫苗产生抗体，通过检测血清能判定动物是否发生感染
鉴别困难，不能通过检测血清来判定是否发生感染
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